Cet article a été écrit en réponse à un message de la communauté qui demandait si Python pouvait créer des messages HL7 de manière dynamique.

Conditions préalables et configuration

Utilisez un espace de noms compatible avec l'intégration.
Remarque : l'espace de noms USER n'est pas activé pour l'interopérabilité par défaut.
Si nécessaire, créez un nouvel espace de noms interopérable afin d'explorer les fonctionnalités.

# Passage à
ZN "[Espace de nom pour l'interopérabilité]"

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Article
· Oct 16, 2023 8m de lecture
Support des vecteurs, enfin presque

Aujourd'hui, il y a beaucoup de bruit autour du LLM, de l'IA, etc. Les bases de données vectorielles en font partie, et il existe déjà de nombreuses réalisations différentes pour le support en dehors d'IRIS.

Pourquoi Vector?

  • Recherche de similarité : Les vecteurs assurent une recherche de similarité efficace, par exemple en trouvant les éléments ou les documents les plus similaires dans un ensemble de données. Les bases de données relationnelles classiques sont conçues pour des recherches de correspondances exactes, qui ne sont pas adaptées à des tâches telles que la recherche de similitudes d'images ou de textes.
  • Flexibilité : Les représentations vectorielles sont polyvalentes et peuvent être obtenues à partir de différents types de données, tels que du texte (via des embeddings comme Word2Vec, BERT), des images (via des modèles d'apprentissage profond), et autres.
    • Recherches multimodales** : Les vecteurs permettent d'effectuer des recherches dans différentes modalités de données. Par exemple, avec une représentation vectorielle d'une image, on peut rechercher des images similaires ou des textes connexes dans une base de données multimodale.

Et pour bien d'autres raisons encore.

Donc, pour ce concours python, j'ai décidé de mettre en place ce support. Et malheureusement, je n'ai pas réussi à le terminer à temps, je vais vous expliquer pourquoi.

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La série d'articles relatifs à l'application QuinielaML se poursuit. Dans cet article, nous verrons comment préparer les données brutes que nous avons capturées à l'aide de la fonctionnalité Embedded Python.

Bienvenue à toutes et à tous !

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En profitant de l'application Quiniela ML et comme nous l'avons dit dans l'article précédent, nous allons expliquer comment nous pouvons réaliser une authentification JWT entre notre frontend développé en Angular et notre backend développé en InterSystems IRIS.

Je vous rappelle l'architecture de notre projet QuinielaML :

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Bienvenue chers membres de la Communauté à la présentation et au premier article d'un petit projet qui présentera les capacités d'InterSystems IRIS à fournir une fonctionnalité de sauvegarde complète pour une application web développée en Angular. Dans cet article, nous nous contenterons de présenter le concept ainsi que les fonctionnalités d'InterSystems IRIS utilisées de manière générale, en allant plus en détail dans les articles suivants.

Bienvenue à QuinielaML !

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Description du cas

Imaginons que vous soyez un développeur en Python ou que vous disposiez d'une équipe bien formée et spécialisée en Python, mais que le délai qui vous est imparti pour analyser certaines données dans IRIS soit serré. Bien sûr, InterSystems offre de nombreux outils pour toutes sortes d'analyses et de traitements. Cependant, dans le scénario donné, il est préférable de faire le travail en utilisant le bon vieux Pandas et de laisser IRIS pour une autre fois.

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Pour le prochain Concours Python, j'aimerais faire une petite démo, sur la création d'une simple application REST en Python, qui utilisera IRIS comme base de données. Et utiliser les outils suivants

  • Le cadre FastAPI, très performant, facile à apprendre, rapide à coder, prêt pour la production.
  • SQLAlchemy est la boîte à outils SQL et le Mapping objet-relationnel de Python qui donne aux développeurs en Python toute la puissance et la flexibilité de SQL.
  • Alembic est un outil léger de migration de base de données à utiliser avec le SQLAlchemy Database Toolkit pour Python.
  • Uvicorn est une implémentation de serveur web ASGI pour Python.
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Parfois, nous devons savoir avec certitude si l'environnement actuel dispose de suffisamment de noyaux, de mémoire et de bande passante pour prendre en charge le nombre prévu d'utilisateurs et les accords de niveau de service tels que la latence, le temps de réponse et la disponibilité. C'est le cas pour les bases de données et les backends. C'est pourquoi il est obligatoire, pour les applications et les bases de données critiques, de simuler les demandes simultanées/concurrentes des utilisateurs et de collecter des données sur les performances et la disponibilité.

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Article
· Sept 22, 2023 8m de lecture
Stratégie Python pour Iris FHIR

Description

Avec le Serveur InterSystems IRIS FHIR, vous pouvez construire une stratégie pour personnaliser le comportement du serveur (pour plus de détails, consultez documentation).

Image

Ce référentiel contient une stratégie Python qui peut être utilisée comme point de départ pour construire votre propre stratégie en Python.

Cette stratégie de démonstration présente les caractéristiques suivantes :

  • Mettre à jour la déclaration de capacité pour supprimer la ressource Account (compte).
  • Simuler un système de gestion de consentement pour accorder ou non l'accès à la ressource Observation.
    • Si l'utilisateur a des droits suffisants, la ressource Observation est renvoyée.
    • Sinon, la ressource Observation n'est pas renvoyée.
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Salut les devs,

Aujourd’hui j’aimerais aborder un sujet qui m’a fait passer des moments difficiles (j’en suis convaincu, celà a déjà dû être le cas d’un bon nombre d’entre-vous) “le bottleneck”. C’est un sujet très vaste, cet article se concentrera sur l’identification des requêtes HTTP entrantes qui pourraient être à l’origine de problèmes de lenteur. Je vous mettrai aussi à disposition un petit outil que j’ai développé pouvant aider à leur identification.

Nos logiciels deviennent de plus en plus complexes, traitent un grand nombre de requêtes provenant de différentes sources, il peut s’agir d'applications front-end ou de tiers applications back-end. Pour garantir des performances optimales, il est essentiel de disposer d'un système de log capable de prendre quelques mesures clés telles que le temps de réponse, le nombre de global référence et le nombre de lignes de code exécutées pour chaque réponse HTTP. Dans le cadre de mon travail, je suis impliqué dans le développement d’un logiciel dossier patient informatisé ainsi que sur l’analyse des incidents. La charge utilisateur provient essentiellement de requêtes HTTP (API REST ou application CSP), la nécessité de disposer de ce type de mesure lorsque des problèmes de lenteur généralisée se produisent est devenu une évidence.

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La méthode InstallFoundation est manquante (IRIS 2023.2+)

IRIS 2023.2 est récemment sorti. Cette version a supprimé cette méthode InstallFoundation de cette classe HS.HC.Util.Installer. Il s’agissait d’une méthode privée et elle n’était pas documentée. Mais il a été largement utilisé par la communauté pour installer le serveur FHIR.

Donc si vous rencontrez cette erreur :

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Article
· Sept 18, 2023 22m de lecture
Déploiement local d'un serveur FHIR sur K8s

k8s

Voici un exemple de déploiement de iris-oauth-fhir sur k3d avec IKO.
* iris-oauth-fhir est un exemple de déploiement d'un serveur FHIR avec authentification OAuth2 en utilisant InterSystems IRIS for Health comme serveur de ressources et Google OpenId comme serveur d'autorisation.
* k3d est un wrapper léger pour exécuter k3s (la distribution Kubernetes minimale de Rancher Lab) dans docker.
* IKO est un outil permettant de déployer InterSystems IRIS for Health sur Kubernetes.

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Salut les développeurs,

Dans cet article, je vais vous montrer comment exécuter du code au moment de la compilation avec les macros ObjectScript.

Voici un cas d'utilisation qui m'a récemment amené à utiliser cette fonctionnalité :

Dans le cadre d'une application médicale développée depuis plus de 20 ans, nous avons un grand nombre de paramètres. Bien que nous disposions de procédures pour documenter ces paramètres, il peut être utile d'avoir une vue rapide sur les paramètres réellement utilisés par le code de l'application.

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Article
· Sept 14, 2023 8m de lecture
Procédure stockée en Embedded Python

Aperçu

La documentation en ligne contient une référence expliquant comment définir et utiliser les requêtes de classes.

La personnalisation des procédures stockées en ObjectScript s'est avérée utile pour accéder au stockage NoSQL et à la messagerie externe via l'intégration, afin de présenter la sortie sous forme de tableau.

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Article
· Sept 8, 2023 6m de lecture
Gardez vos images iris docker en forme ;)

iris-docker-multi-stage-script

Un script python pour garder vos images docker iris en forme ;)

Sans changer votre dockerfile ou votre code vous pouvez réduire la taille de votre image de 50% ou plus !

TL;DR

Nommez l'image de constructeur builder et l'image finale final et ajoutez ceci à la fin de votre fichier Dockerfile :

Modifiez votre fichier Dockerfile pour utiliser une construction multi-étapes :

ARG IMAGE=intersystemsdc/irishealth-community:latest
FROM $IMAGE as builder

Ajoutez ceci à la fin de votre fichier Dockerfile:

FROM $IMAGE as final

ADD --chown=${ISC_PACKAGE_MGRUSER}:${ISC_PACKAGE_IRISGROUP} https://github.com/grongierisc/iris-docker-multi-stage-script/releases/latest/download/copy-data.py /irisdev/app/copy-data.py

RUN --mount=type=bind,source=/,target=/builder/root,from=builder \
    cp -f /builder/root/usr/irissys/iris.cpf /usr/irissys/iris.cpf && \
    python3 /irisdev/app/copy-data.py -c /usr/irissys/iris.cpf -d /builder/root/

Boum ! Vous avez terminé !

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pour démonter/monter une base de données, utilisez les méthodes Dismount() et Mount() dans la classe SYS.Database disponible dans l'espace de noms %SYS.
NB : l'ID de la base de données est le nom du chemin absolu de son répertoire.

Vous trouverez quelques exemples de démontage/montage et de méthodes contrôlant si une base de données est montée (Mounted=1) ou non (Mounted=0), ou affichant rapidement tous les attributs d'une base de données (via zwrite)

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Salut la communauté,


Dans mon article précédent, nous avons appris les sujets répertoriés ci-dessous :

  1. Qu’est-ce que Docker ?
  2. Certains des avantages de Docker
  3. Comment fonctionne Docker ?
  4. Image Docker
  5. Conteneur Docker
  6. Dépôt d'images Docker
  7. Dépôt d'images Docker d'InterSystems
  8. Installation de Docker
  9. Commandes de base de Docker
  10. Exécution de l'édition communautaire IRIS à l'aide de Docker
  11. Interface graphique du bureau Docker

Dans cet article, nous aborderons les sujets suivants

  1. Utilisation du fichier Docker Compose (un fichier YAML)
  2. Utilisation du fichier Docker (utilisé pour créer une image Docker)
  3. Utilisation du volume Docker

Alors commençons.

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Hibernate est le framework le plus populaire pour réaliser des projets ORM (Mapping Objet-Relationnel). Avec Hibernate, un logiciel peut utiliser les principaux SGBD du marché, et même changer de fournisseur de base de données à tout moment, sans impact sur le code source. Cela est possible car Hibernate prend en charge les dialectes. Chaque produit de base de données a un dialecte différent qui peut être assigné dans un fichier de configuration.

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Lorsque nous démarrons le développement avec IRIS, nous disposons d'un kit de distribution ou, dans le cas de Docker, nous extrayons l'image Docker, puis nous devons souvent l'initialiser et configurer l'environnement de développement. Nous devrons peut-être créer des bases de données, des espaces de noms, activer/désactiver certains services, créer des ressources. Nous devons souvent importer du code et des données dans l'instance IRIS et exécuter du code personnalisé pour lancer la solution.

Lajos Simicska declares war on Viktor Orban: "It's either him or me!" - The  Budapest Beacon

Il existe de nombreux modèles sur Open Exchange dans lesquels nous suggérons comment initialiser REST, l'interopérabilité, l'analytics, le développement Fullstack et bien d'autres modèles utilisant ObjectScript. Mais qu'en est-il si nous souhaitons utiliser uniquement Python pour configurer l'environnement de développement d'un projet Embedded Python avec IRIS ?

De fait, la récente sortie de Embedded Python template est devenu le passe-partout du pur Python qui pourrait être un point de départ pour les développeurs qui créent des projets Python sans avoir besoin d'utiliser et d'apprendre ObjectScript. Cet article explique comment ce modèle pourrait être utilisé pour initialiser IRIS. C'est parti!

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Description du cas

Imaginons que vous soyez un développeur Python ou que vous disposiez d'une équipe bien formée et spécialisée en Python, mais que le délai dont vous disposez pour analyser certaines données dans IRIS est serré. Bien entendu, InterSystems propose de nombreux outils pour toutes sortes d’analyses et de traitements. Cependant, dans le scénario donné, il est préférable de faire le travail en utilisant les bons vieux Pandas et de laisser l'IRIS pour une autre fois.

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Pour parler des différentes bases de données et des différents modèles de données qui existent, on doit premièrement comprendre ce qui est une base de données et comment les utiliser.

Une base de données est une collection organisée de données stockées et accessibles par voie électronique. Elle permet de stocker et de retrouver des données structurées, semi-structurées ou des données brutes souvent en rapport avec un thème ou une activité.

Au cœur de chaque base de données se trouve au moins un modèle utilisé pour décrire ses données. Et selon le modèle sur lequel elle est basée, elle peut avoir des caractéristiques un peu différentes et stocker différents types de données.

Pour inscrire, retrouver, modifier, trier, transformer ou imprimer les informations de la base de données on utilise un logiciel qui s’appelle système de gestion de base de données (SGBD, en anglais DBMS pour Database management system).

La taille, les capacités et les performances des bases de données et de leurs SGBD respectifs ont augmenté de plusieurs ordres de grandeur. Ces augmentations de performances ont été rendues possibles par les progrès technologiques dans différents domaines, tels que les domaines des processeurs, de la mémoire informatique, du stockage informatique et des réseaux informatiques. Le développement ultérieur de la technologie des bases de données peut être divisé en quatre générations basées sur le modèle ou la structure des données : navigation, relationnel, objet et post-relationnel.

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Bonjour les développeurs, Je suis actuellement en train de faire une démo sur la construction d'une interface utilisateur en front-end faisant de l'analyse de données et de mettre en place un test de performance avec de gros objets de données, donc l'utilisation de "Populate Utility" pourrait m'aider à générer automatiquement des échantillons de données avec lesquels je pourrais jouer.

Dans ce post, j'aimerais partager mon expérience de l'utilisation de Populate Utility, y compris l'utilisation du paramètre POPSPEC.

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Rubrique FAQ InterSystems

Vous pouvez voir l'espace disponible libre pour la base de données à l'aide du bouton radio « Vue de l'espace libre » dans le portail de gestion : Exploitation du système > Bases de données.

Et il peut être obtenu par programmation par la requête FreeSpace de la classe système SYS.Database.

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