Bonjour la Communauté !

Je voulais vous partager mes impressions du Meetup FHIR France #13, organisé par Fyrstain et sponsorisé par InterSystems – et franchement, c’était une soirée inoubliable ! C’était une soirée riche en échanges, en apprentissages et en belles rencontres !

L’accueil a débuté à 19h et @Guillaume Rongier a aidé à enregistrer les participants

Après avoir laissé les participants arriver tranquillement, nous avons officiellement lancé la soirée. Fanch Rouault a souhaité la bienvenue au nom de Fyrstain

Dans l'article précédent, nous avons présenté l'architecture de notre projet SMART On FHIR, il est donc temps de passer aux choses sérieuses et de commencer à configurer tous les éléments qui seront nécessaires.

Nous commençons avec Auth0.

Configuration de l'Auth0

Commençons par créer un compte Auth0 avec un email valide, une fois enregistré il nous faut créer notre première application, et nous le ferons à partir du menu de gauche:

Bonjour collègues !

Lors du développement d'une application front-end ou de toute autre communication avec l'API REST, il est souvent judicieux d'utiliser une Swagger UI, une interface de test pour l'API REST conforme à la spécification Open API 2.0. Elle est généralement très pratique, car elle permet d'effectuer des tests manuels rapides avec l'API REST, ses réponses et les données qu'elle contient.

J'ai récemment intégré la prise en charge de Swagger dans InterSystems IRIS FHIR template pour l'API FHIR R4 :

Comment le faire fonctionner.

Les fournisseurs de solutions numériques dans le domaine de la santé sont soumis à une pression croissante pour intégrer des systèmes complexes de données de santé tout en garantissant l'évolutivité, la sécurité et la conformité à des normes telles que HL7 FHIR. Les ressources FHIR (Fast Healthcare Interoperability Resources) ont révolutionné l'échange de données de santé en proposant un cadre normalisé qui permet à divers systèmes informatiques de santé de communiquer sans difficulté. Mais il ne suffit pas de se conformer aux normes FHIR pour surmonter les complexités de l'intégration des données de santé. Les partenaires de solutions doivent tirer parti de composants architecturaux avancés tels que les courtiers, les façades et les référentiels FHIR pour créer des solutions évolutives et efficaces. InterSystems offre toutes les fonctionnalités essentielles dont vous avez besoin pour mettre en œuvre FHIR pour vos données de santé, que ce soit sur site, dans un cloud public ou sous forme de service cloud géré par InterSystems.

Introduction

Dans mon article précédent, j'ai présenté le module IRIStool, qui intègre de manière transparente la bibliothèque pandas pour Python à la base de données IRIS. Je vais maintenant vous expliquer comment utiliser IRIStool pour exploiter InterSystems IRIS comme base pour une recherche sémantique intelligente dans les données de soins de santé au format FHIR.

Cet article décrit ce que j'ai fait pour créer une base de données pour mon autre projet, FHIR Data Explorer. Les deux projets sont candidats au concours InterSystems actuel, alors n'hésitez pas à voter pour eux si vous les trouvez utiles.

Ils sont disponibles sur Open Exchange:

• IRIStool et Data Manager
• FHIR Data Explorer

Dans cet article, nous aborderons les sujets suivants:

• Connexion à la base de données InterSystems IRIS via Python
• Création d'un schéma de base de données compatible FHIR
• Importation de données FHIR au moyen d'intégrations vectorielles pour la recherche sémantique

Nous sommes présent au rendez Meetup FHIR #11 : API Mon Espace Santé - Paris & Online

Welcome de Nicolas :

BIENVENUE par Nicolas RISS

Meetup FHIR #11 : API Mon Espace Santé - Paris & Online

https://esante.gouv.fr/produits-services/ci-sis

Introduction

Dans mon dernier article, j'ai présenté FHIR Data Explorer, une application de validation de concept qui connecte InterSystems IRIS, Python, et Ollama afin de permettre la recherche sémantique et la visualisation des données de soins de santé au format FHIR. Ce projet participe actuellement au concours InterSystems External Language Contest.

Dans cette suite, nous verrons comment j'ai intégré Ollama pour générer les résumés des dossiers médicaux directement à partir des données FHIR structurées stockées dans IRIS, à l'aide de modèles linguistiques locaux légers (LLM) tels que Llama 3.2:1B ou Gemma 2:2B.

L'objectif était de créer un pipeline d'IA entièrement local capable d'extraire, de formater et de présenter les dossiers médicaux des patients tout en garantissant la confidentialité et le contrôle total des données.

Toutes les données des patients utilisées dans cette démonstration proviennent de paquets FHIR, qui ont été analysés et chargés dans IRIS via le module IRIStool. Cette approche facilite la requête, la conversion et la vectorisation des données de soins de santé à l'aide d'opérations pandas familières en Python. Si vous désirez en savoir plus sur la manière dont j'ai construit cette intégration, consultez mon article précédent Création d'un référentiel vectoriel FHIR avec InterSystems IRIS et Python via le module IRIStool.

Les deux outils, IRIStool et FHIR Data Explorer sont disponibles sur InterSystems Open Exchange — et font partie de mes contributions au concours. Si vous les trouvez utiles, n'hésitez pas à voter pour eux!

• IRIStool et Data Manager
• FHIR Data Explorer

Ajouter un identifiant pour se connecter à l'interface FHIR REST - dans ce cas, ne considérer qu'une authentification de base

Cet article a pour objectif de fournir au lecteur les informations suivantes:

• Configuration et utilisation du serveur FHIR
• Création d'un serveur d'autorisation OAuth2
• Liaison entre le serveur FHIR et le serveur d'autorisation OAuth2 pour la prise en charge de SMART sur FHIR
• Utilisation des capacités d'interopérabilité dans "IRIS for Health" pour filtrer les ressources FHIR
• Création d'une opération personnalisée sur le serveur FHIR

Schéma de l'article:

Certainement, vous avez tous entendu que FHIR était la panacée et la solution à tous les problèmes d'interopérabilité et de compatibilité entre les systèmes. Ici, nous pouvons voir l'un de ses défenseurs classiques qui tient une ressource FHIR dans sa main et l'apprécie énormément :

Mais pour le reste de nous autres mortels, nous allons faire une petite introduction.

Bonjour à tous,

Continuons à travailler sur la génération de données de test et l'exportation des résultats via une API REST. 😁

Ici, je souhaite réutiliser la classe `datagen.restservice` créée dans l'article précédent : « Écriture d'un service API REST pour exporter les données patient générées au format .csv ».

Serveur FHIR

Le Serveur FHIR est une application logicielle qui met en œuvre la norme FHIR (Fast Healthcare Interoperability Resources), ce qui permet aux systèmes de soins de santé de Stocker, accéder, échanger, et gérer les données de soins de santé de manière standardisée.

InterSystems IRIS permet de stocker et de récupérer les ressources FHIR suivantes:

• Référentiel de ressources – Le serveur natif IRIS FHIR permet de stocker facilement les paquets/ressources FHIR directement dans le référentiel FHIR.
• Façade FHIR – La couche de façade FHIR est un modèle d'architecture logicielle à l'aide duquel une API compatible FHIR peut être exposée au-dessus d'une API existante (souvent non-FHIR). Cette couche permet également de rationaliser le système de données de soins de santé, y compris les dossiers médicaux électroniques (DME), les bases de données existantes ou le stockage de messages HL7 v2, sans nécessiter la migration de toutes les données vers un système natif FHIR.

Qu'est-ce que FHIR?

FHIR (Fast Healthcare Interoperability Resources) est un framework standard créé par HL7 International afin de faciliter l'échange de données de soins de santé de manière flexible, conviviale pour les développeurs et moderne. Il exploite les technologies web contemporaines pour assurer une intégration et une communication transparentes entre plusieurs systèmes de soins de santé.

Bonjour à tous, c'est avec grand plaisir que je vous annonce la V2 de mon application 'Contest-FHIR'.

Dans cette nouvelle version, j'ai utilisé de nouveaux outils et techniques que j'ai découverts lors de l'EUROPEAN HEALTHCARE HACKATHON auquel j'ai été invité par InterSystems en tant qu'invité et mentor pour présenter les multiples projets que j'ai réalisés lors de mon stage en avril 2022.

Aujourd'hui je vous présente la V2 de mon application, elle peut maintenant transformer un fichier CSV en FHIR en SQL en JUPYTER notebook.

InterSystems IRIS for Health v2024.3 est déjà disponible en tant qu'aperçu pour les développeurs depuis un certain temps, et je voulais souligner la nouvelle prise en charge liée à la recherche FHIR qui a été introduite.

Il existe deux modificateurs dont la prise en charge a été ajoutée :

• not
• missing