Traitement des ressources FHIR avec FHIR SQL BUILDER pour prédire la probabilité de développer une hépatite C

Avec le développement de la technologie, l'industrie médicale progresse également constamment et les humains accordent souvent plus d'attention à leur propre santé.
En apprenant et en traitant des ensembles de données par ordinateur, les maladies peuvent être prédites.

Prérequis: Capacité à utiliser FHIR et ML

4 2
0 26

Introduction

Dans un article précédent, j'ai abordé les modèles d'exécution des tests unitaires via le gestionnaire de paquets ObjectScript. Cet article va un peu plus loin, en utilisant les actions GitHub pour piloter l'exécution des tests et la création de rapports. Le cas d'utilisation qui nous motive est l'exécution du CI pour l'un de mes projets Open Exchange, AppS.REST (voir l'article d'introduction à ce projet ici). Vous pouvez voir l'implémentation complète dont les extraits de cet article ont été tirés sur GitHub ; elle pourrait facilement servir de modèle pour l'exécution de l'IC pour d'autres projets utilisant le gestionnaire de paquets ObjectScript.

Les fonctionnalités dont la mise en œuvre a été démontrée comprennent :

  • Compilation et test d'un paquet ObjectScript
  • Rapport sur la mesure de la couverture des tests (en utilisant le paquet TestCoverage) via codecov.io
  • Téléchargement d'un rapport sur les résultats des tests en tant qu'artefact de comppilation.
3 0
0 56

Rubrique FAQ InterSystems

Vous pouvez définir des pages d'erreur individuelles en fonction des différents types de messages d'erreur ou de réponses système de la passerelle Web :

  • erreur de serveur
  • serveur occupé
  • serveur indisponible
  • délai d'attente du serveur
  • connexion fermée

Les paramètres sont définis sur l'écran Gestion de passerelle Web ([Portail d'Administration] > [Administration système] > [Configuration] > [Gestion de passerelle Web] > [Configuration] > [Default Parameters]).

Dans la section "Error Pages" du menu "Default Parameters", indiquez le nom de fichier de la page html à afficher ou l'URL vers laquelle rediriger la réponse lorsqu'une erreur se produit.

3 1
0 36
Article
· Nov 17, 2023 3m de lecture
Comment cacher le programme source

Rubrique Questions fréquentes (FAQ) d'InterSystems

Pour les routines (*.mac)

Vous pouvez masquer la source en exportant/important uniquement le fichier *.obj généré après la compilation du programme source.

L'exemple d'exécution de la commande spécifie EX1Sample.obj et EX2Sample.obj, qui sont générés par la compilation de EX1Sample.mac et EX2Sample.mac, comme cibles d'exportation et les exporte dans le deuxième fichier argument.

Après avoir changé d'espace de noms, j'utilise le fichier XML exporté pour effectuer l'importation.

3 0
0 36
Article
· Août 24, 2023 9m de lecture
Application Java Quarkus fonctionnant avec IRIS

À titre d'exemple d'application en Java fonctionnant avec le dialecte Hibernate pour IRIS, je souhaitais utiliser l'application RealWorld et j'ai trouvé une réalisation pour Quarkus. L'application RealWorld est un exemple d'application proche d'une application réelle, avec des tests déjà préparés pour le backend. La plupart des exemples de réalisations sont à retrouver ici

RealWorld Example App

L'exemple d'application RealWorld est souvent appelé « Wikipédia pour la création d'applications full-stack ». Il sert de prototype standardisé que les développeurs peuvent utiliser pour créer des applications à l'aide de divers langages et frameworks de programmation. L'application fournit un cas d'utilisation réel en imitant une plate-forme de blogs, avec des fonctionnalités telles que l'authentification des utilisateurs, la gestion des profils, la publication d'articles et les commentaires. Avec un ensemble complet de spécifications, y compris une documentation d'API backend prête à l'emploi et des conceptions frontend, il permet aux développeurs de voir comment les mêmes exigences fonctionnelles sont mises en œuvre dans différentes piles technologiques. L'exemple RealWorld est largement utilisé comme outil d'apprentissage et comme référence pour comparer diverses technologies.

Quarkus

Quarkus est un framework Java open source natif de Kubernetes, conçu pour GraalVM et HotSpot. Créé dans le but d'améliorer l'environnement cloud natif moderne, il réduit considérablement l'empreinte et le temps de démarrage des applications Java. Quarkus est connu pour sa philosophie « privilégiant le conteneur », permettant aux développeurs de créer des applications légères et performantes en mettant l'accent sur l'architecture des microservices. Cette flexibilité en a fait un choix populaire pour les organisations cherchant à passer à des plates-formes sans serveur ou basées sur le cloud, combinant des modèles de programmation impératifs et réactifs. Qu'il s'agisse d'une application Web traditionnelle ou d'un système complexe de microservices, Quarkus fournit une plate-forme robuste pour créer des logiciels évolutifs et maintenables.

3 0
0 32

InterSystems FAQ rubric

Les mappages globaux peuvent être enregistrés à l'aide de la classe système Config.MapGlobals.

La méthode pour mapper globalement ^Sample.PersonD dans une base de données SAMPLES autre que la base de données par défaut de l'espace de noms USER est la suivante (exemple exécuté dans un terminal).

3 0
0 26

Bonjour La Communauté,

Le langage SQL reste le moyen le plus pratique pour récupérer de l'information stockée en base de données.

Le format JSON est très souvent utilisé dans les échanges de données.

Il est donc fréquent de chercher à obtenir des données au format JSON à partir de requêtes SQL.

Vous trouverez ci-dessous des exemples simples qui pourront vous aider à répondre à ce besoin à partir de code en ObjectScript et en Python.

3 1
0 71
Article
· Oct 20, 2023 8m de lecture
Les Notes du FHIR User Day à Rennes

Bonjour à toutes et à tous !

InterSystems a sponsorisé le FHIR User Day qui a eu lieu lors de la semaine européenne de la e-santé. Et je voudrais partager avec vous mes notes de cet événement. Mais avant ça, j'ai le plaisir à vous infirmer que la journée a été entièrement filmée. Les vidéos des différentes interventions seront transmises dans les semaines à venir. Restez à l'écoute!

Sans perte de temps, voici toute l'info.

3 0
0 84

La classe %CSP.Login est la classe utilitaire fournie par InterSystems IRIS pour créer des pages de connexion personnalisées. Si vous souhaitez contrôler l'interface utilisateur d'authentification de votre application IRIS, vous devez étendre %CSP.Login et surcharger certaines méthodes en fonction de vos besoins. Cet article va détailler ces méthodes et ce que vous pouvez faire avec elles. En outre, vous obtiendrez une explication du mécanisme d'authentification déléguée fourni par la routine ZAUTHENTICATE.mac.

2 0
0 11

Bonjour à la communauté,

C'est mon premier message dans la communauté des développeurs - j'apprécierais tout retour d'information !

A des fins de tests ou de démonstrations, vous pouvez vouloir envoyer des emails à partir de votre production d'interopérabilité. Dans ce billet, je vais vous aider à connecter une production IRIS d'InterSystems à Gmail afin que vous puissiez l'utiliser pour envoyer des alertes par email.

Traduit avec DeepL.com (version gratuite)

2 0
0 26

Le nuage Amazon Web Services (AWS) offre un large éventail de services d'infrastructure, tels que des ressources de calcul, des options de stockage et des réseaux, qui sont fournis comme un service public : à la demande, disponibles en quelques secondes, avec une tarification à l'usage. De nouveaux services peuvent être mis à disposition rapidement, sans dépenses d'investissement initiales. Les entreprises, les start-ups, les petites et moyennes entreprises et les clients du secteur public peuvent ainsi accéder aux éléments de base dont ils ont besoin pour répondre rapidement à l'évolution des exigences commerciales.

Updated: 2-Apr, 2021

2 0
0 100

Rubrique FAQ InterSystems

Vous pouvez voir l'espace disponible libre pour la base de données à l'aide du bouton radio « Vue de l'espace libre » dans le portail de gestion : Exploitation du système > Bases de données.

Et il peut être obtenu par programmation par la requête FreeSpace de la classe système SYS.Database.

2 0
0 32
Article
· Nov 24, 2023 4m de lecture
Un framework oui, mais un framework adapté

Comment déployer les productions IRIS sereinement et plus rapidement ?

L'objectif des productions d'interopérabilité est de vous permettre de connecter des systèmes afin de transformer et d'acheminer des messages entre eux. Pour connecter des systèmes, vous développez, configurez, déployez et gérez des productions qui intègrent plusieurs solutions.

2 0
0 45
Article
· Mars 2 4m de lecture
IKO - Leçons (Partie 1 - Helm)

La documentation d'IKO est solide. Une seule page web contient environ 50 pages de documentation. Pour les débutants, cela peut être un peu accablant. Comme le dit le proverbe : comment manger un éléphant ? Une bouchée à la fois. Commençons par la première bouchée : helm.

Qu'est-ce que Helm ?

Helm est à Kubernetes ce que l'InterSystems Package Manager (IPM, anciennement ObjectScript Package Manager - ZPM) est à IRIS.

2 0
0 19
Article
· Nov 30, 2022 4m de lecture
Contenu du message HL7 ACK et un example

Dans l'article précédent, nous avons vu le contenu du message ORM et du message de réponse ORU. Examinons maintenant de plus près le message ACK.

Chaque fois qu'une application réceptrice accepte un message et consomme les données du message, elle est censée renvoyer un message ACKnowledgement (ACK) à l'application émettrice. L'application émettrice est censée continuer à envoyer un message jusqu'à ce qu'elle ait reçu un message ACK. C'est une partie importante de la norme HL7, le protocole de la confirmation de réception.

2 0
0 183
Article
· Mai 15, 2023 5m de lecture
Tuples en tête

Aperçu général

En passant d'IRIS objectScript à Python, on s'aperçoit qu'il existe des différences syntaxiques fascinantes.

L'une d'entre elles concerne la manière dont Python renvoie des tuples à partir d'une méthode à décompression automatique.

En fait, il s'agit d'une méthode qui renvoie plusieurs valeurs. Quelle invention géniale :)

out1, out2 = some_function(in1, in2)

ObjectScript a une autre approche avec les paramètres ByRef et Output.

Do ##class(some_class).SomeMethod(.inAndOut1, in2, .out2)

Où:

2 0
0 40

InterSystems rubrique FAQ

Vous pouvez utiliser la classe %IndexBuilder pour effectuer la reconstruction d'index dans plusieurs processus parallèles.

Voici un exemple dans le but de définir l'index standard HomeStateIdx pour la colonne Home_State (informations de l'État de l'adresse du domicile) de Sample.Person.

Les étapes sont les suivantes:

1. Masquez le nom de l'index à ajouter/reconstruire à partir de l'optimiseur de requêtes.

2 0
0 13

InterSystems FAQ rubric

Record maps sont utilisés pour faire correspondre efficacement des fichiers contenant des enregistrements délimités ou des enregistrements de largeur fixe aux classes de messages utilisées par la fonction d'interopérabilité, et pour faire correspondre des fichiers de classes de messages de la fonction d'interopérabilité à des fichiers texte.

2 0
0 8

Un système de stockage global d'aspect plus industriel

Dans le premier article de cette série, nous avons étudié le modèle entité-attribut-valeur (EAV) dans les bases de données relationnelles, et nous avons examiné les avantages et les inconvénients du stockage de ces entités, attributs et valeurs dans des tables. Nous avons appris que, malgré les avantages de cette approche en termes de flexibilité, elle présente de réels inconvénients, notamment une inadéquation fondamentale entre la structure logique des données et leur stockage physique, qui entraîne diverses difficultés.

Pour résoudre ces problèmes, nous avons décidé de voir si l'utilisation de globales - qui sont optimisées pour le stockage d'informations hiérarchiques - serait efficace pour les tâches que l'approche EAV traite habituellement.

Dans la Partie 1, nous avons créé un catalogue pour une boutique en ligne, d'abord en utilisant des tables, puis en utilisant une seule globale. Maintenant, essayons d'implémenter la même structure pour quelques globales.

Dans la première globale, ^catalog, nous allons stocker la structure du répertoire. Dans la deuxième globale, ^good, nous allons stocker les marchandises. Et dans la globale ^index, nous allons stocker les index. Puisque nos propriétés sont liées à un catalogue hiérarchique, nous ne créerons pas de globale séparée pour elles.

Avec cette approche, pour chaque entité (à l'exception des propriétés), nous avons une globale séparée, ce qui est bon du point de vue de la logique. Voici la structure du catalogue global :

2 0
0 217

L’interopérabilité dans le secteur de la santé a fait l’objet d’une attention particulière au cours de la dernière décennie, tant dans le cadre législatif que dans le secteur des technologies de la santé. Les API constituent un espace de développement crucial pour une meilleure interopérabilité, et de nombreux développeurs de systèmes d’information hospitalier (SIH) les déploient pour améliorer les offres de logiciels intégrés.

2 0
0 42

FTP ( Protocole de transfert de fichiers) est un protocole de réseau permettant de transmettre des fichiers sur des connexions TCP/IP dans un réseau (y compris l'Internet) configuré pour transférer des fichiers via ce protocole. Dans une transaction FTP, un expéditeur de fichiers est appelé hôte local. Un récepteur de fichiers impliqué dans le FTP est un hôte distant, et il s'agit généralement d'un serveur.

2 0
0 109

Dans cet article, nous allons voir comment utiliser le service de messagerie instantanée WhatsApp depuis InterSystems IRIS pour envoyer des messages à différents destinataires. Pour ce faire, nous devons créer et configurer un compte dans Meta et configurer une opération métier pour envoyer les messages que nous souhaitons.

Examinons chacune de ces étapes plus en détail.

2 0
0 22