#InterSystems IRIS for Health

Salut la communauté,

Dans mon article précédent, nous avons appris les sujets répertoriés ci-dessous :

1. Qu’est-ce que Docker ?
2. Certains des avantages de Docker
3. Comment fonctionne Docker ?
4. Image Docker
5. Conteneur Docker
6. Dépôt d'images Docker
7. Dépôt d'images Docker d'InterSystems
8. Installation de Docker
9. Commandes de base de Docker
10. Exécution de l'édition communautaire IRIS à l'aide de Docker
11. Interface graphique du bureau Docker

Dans cet article, nous aborderons les sujets suivants

1. Utilisation du fichier Docker Compose (un fichier YAML)
2. Utilisation du fichier Docker (utilisé pour créer une image Docker)
3. Utilisation du volume Docker

Alors commençons.

Rubrique FAQ InterSystems

Vous pouvez voir l'espace disponible libre pour la base de données à l'aide du bouton radio « Vue de l'espace libre » dans le portail de gestion : Exploitation du système > Bases de données.

Et il peut être obtenu par programmation par la requête FreeSpace de la classe système SYS.Database.

À titre d'exemple d'application en Java fonctionnant avec le dialecte Hibernate pour IRIS, je souhaitais utiliser l'application RealWorld et j'ai trouvé une réalisation pour Quarkus. L'application RealWorld est un exemple d'application proche d'une application réelle, avec des tests déjà préparés pour le backend. La plupart des exemples de réalisations sont à retrouver ici

L'exemple d'application RealWorld est souvent appelé « Wikipédia pour la création d'applications full-stack ». Il sert de prototype standardisé que les développeurs peuvent utiliser pour créer des applications à l'aide de divers langages et frameworks de programmation. L'application fournit un cas d'utilisation réel en imitant une plate-forme de blogs, avec des fonctionnalités telles que l'authentification des utilisateurs, la gestion des profils, la publication d'articles et les commentaires. Avec un ensemble complet de spécifications, y compris une documentation d'API backend prête à l'emploi et des conceptions frontend, il permet aux développeurs de voir comment les mêmes exigences fonctionnelles sont mises en œuvre dans différentes piles technologiques. L'exemple RealWorld est largement utilisé comme outil d'apprentissage et comme référence pour comparer diverses technologies.

Quarkus

Quarkus est un framework Java open source natif de Kubernetes, conçu pour GraalVM et HotSpot. Créé dans le but d'améliorer l'environnement cloud natif moderne, il réduit considérablement l'empreinte et le temps de démarrage des applications Java. Quarkus est connu pour sa philosophie « privilégiant le conteneur », permettant aux développeurs de créer des applications légères et performantes en mettant l'accent sur l'architecture des microservices. Cette flexibilité en a fait un choix populaire pour les organisations cherchant à passer à des plates-formes sans serveur ou basées sur le cloud, combinant des modèles de programmation impératifs et réactifs. Qu'il s'agisse d'une application Web traditionnelle ou d'un système complexe de microservices, Quarkus fournit une plate-forme robuste pour créer des logiciels évolutifs et maintenables.

Ci-dessous figure une liste de certains des utilitaires disponibles dans InterSystems IRIS.

Cliquez sur le nom de chaque utilitaire dans le tableau ci-dessous pour obtenir des informations détaillées sur l'utilitaire.

Le code source de l'article est disponible à l'adresse suivante : https://github.com/antonum/ha-iris-k8s

Les systèmes de bases de données ont des exigences de sauvegarde très spécifiques qui, dans les déploiements d'entreprise, nécessitent une réflexion et une planification préalables. Pour les systèmes de bases de données, l'objectif opérationnel d'une solution de sauvegarde est de créer une copie des données dans un état équivalent à celui de l'arrêt de l'application en douceur. Les sauvegardes cohérentes avec les applications répondent à ces exigences et Caché fournit un ensemble d'API qui facilitent l'intégration avec des solutions externes pour atteindre ce niveau de cohérence des sauvegardes.

Nos clients ont souvent besoin de configurer HealthShare HealthConnect et IRIS en mode haute disponibilité.

D'autres moteurs d'intégration sur le marché sont souvent présentés comme ayant des configurations de "haute disponibilité", mais ce n'est pas vraiment le cas. En général, ces solutions fonctionnent avec des bases de données externes et donc, si celles-ci ne sont pas configurées en haute disponibilité, lorsqu'un crash de la base de données se produit ou que la connexion à celle-ci est perdue, l'ensemble de l'outil d'intégration devient inutilisable.

Exemple d'utilisation de la base de données FHIR d'InterSystems IRIS for Health pour effectuer de modèles ML via InterSystems IRIS IntegratedML

Bonjour à tous !

Je partage avec vous un outil d'ingestion de données que nous avons utilisé dans certains projets.

DataPipe est un framework d'interopérabilité pour l'ingestion de données dans InterSystems IRIS de manière flexible. Il vous permet de recevoir des données de sources externes, de normaliser et de valider les informations et enfin d'effectuer toutes les opérations dont vous avez besoin avec vos données.

Introduction

Dans un article précédent, j'ai abordé les modèles d'exécution des tests unitaires via le gestionnaire de paquets ObjectScript. Cet article va un peu plus loin, en utilisant les actions GitHub pour piloter l'exécution des tests et la création de rapports. Le cas d'utilisation qui nous motive est l'exécution du CI pour l'un de mes projets Open Exchange, AppS.REST (voir l'article d'introduction à ce projet ici). Vous pouvez voir l'implémentation complète dont les extraits de cet article ont été tirés sur GitHub ; elle pourrait facilement servir de modèle pour l'exécution de l'IC pour d'autres projets utilisant le gestionnaire de paquets ObjectScript.

Les fonctionnalités dont la mise en œuvre a été démontrée comprennent :

• Compilation et test d'un paquet ObjectScript
• Rapport sur la mesure de la couverture des tests (en utilisant le paquet TestCoverage) via codecov.io
• Téléchargement d'un rapport sur les résultats des tests en tant qu'artefact de comppilation.

Bonjour aux développeurs d'InterSystems !

Récemment, j'ai mis à jour le modèle FHIR dev template afin qu'il publie maintenant un paquet IPM fhir-server permettant de faire de la configuration du serveur FHIR d'InterSystems une procédure manuelle, automatique ou programmatique triviale d'une seule commande.

Découvrez ci-dessous comment vous pouvez en bénéficier.

TLDR

USER>zpm "install fhir-server"

Tous les détails ci-dessous.

Les systèmes EHR (Electronic Health Record) sont modélisés dans un format/structure propriétaire et ne sont pas basés sur des modèles du marché tels que FHIR ou HL7. Certains de ces systèmes peuvent interopérer des données dans un format propriétaire pour FHIR et d'autres modèles de marché, mais pas tous. InterSystems dispose de deux plateformes capables d'interopérer des formats propriétaires pour ceux du marché : InterSystems HealthShare Connect et InterSystems IRIS for Health. La fonctionnalité de transformation (DTL - Data Transformation Language) de ces plateformes peut recevoir des données dans n'importe quel format, structure ou canal de communication (CSV, JSON, XML, et autres via FTP, File, HTTP, etc.) et les transformer directement en formats du marché (FHIR, CDA, HL7, etc.). Cependant, InterSystems dispose d'un format intermédiaire appelé SDA (Summary Document Architecture) qui est utilisé par ces plateformes pour générer sans effort des FHIR STU, R3, R4, HL7v2, HL7v3, etc. En outre, lorsqu'elles sont au format SDA, les données de santé peuvent être conservées dans le RCU HealthShare. Ainsi, le format propriétaire/personnel est d'abord transformé en SDA, puis les données peuvent être automatiquement converties dans n'importe quel format du marché, ainsi que sauvegardées dans HealthShare. Dans cet article, nous allons vous montrer comment transformer des données propriétaires/personnalisées en SDA à l'aide d'IRIS for Health. L'exemple de données que nous avons utilisé a été généré par le projet de génération de données en masse SYNTHEA (https://synthea.mitre.org/downloads). Nous allons convertir 1000 patients d'un fichier CSV en SDA, en utilisant les fonctions d'interopérabilité d'IRIS for Health.

Une production simple qui permet de charger des paquets de transactions FHIR dans le serveur FHIR® d'InterSystems® via Box et Dropbox.&nbsp ; En utilisant les composants de connexion MFT inclus et un processus personnalisé Custom Business Process de 14 lignes, cette production traitera vos paquets de transactions vers les ressources FHIR pour une consommation immédiate à la manière magique digne d'Harry Potter. Idéal pour les Hackathons, la recherche et les cocktails FHIR®.

FTP ( Protocole de transfert de fichiers) est un protocole de réseau permettant de transmettre des fichiers sur des connexions TCP/IP dans un réseau (y compris l'Internet) configuré pour transférer des fichiers via ce protocole. Dans une transaction FTP, un expéditeur de fichiers est appelé hôte local. Un récepteur de fichiers impliqué dans le FTP est un hôte distant, et il s'agit généralement d'un serveur.