Traitement des ressources FHIR avec FHIR SQL BUILDER pour prédire la probabilité de développer une hépatite C

Avec le développement de la technologie, l'industrie médicale progresse également constamment et les humains accordent souvent plus d'attention à leur propre santé.
En apprenant et en traitant des ensembles de données par ordinateur, les maladies peuvent être prédites.

Prérequis: Capacité à utiliser FHIR et ML

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Introduction

Dans mon dernier article, j'ai présenté FHIR Data Explorer, une application de validation de concept qui connecte InterSystems IRIS, Python, et Ollama afin de permettre la recherche sémantique et la visualisation des données de soins de santé au format FHIR. Ce projet participe actuellement au concours InterSystems External Language Contest.

Dans cette suite, nous verrons comment j'ai intégré Ollama pour générer les résumés des dossiers médicaux directement à partir des données FHIR structurées stockées dans IRIS, à l'aide de modèles linguistiques locaux légers (LLM) tels que Llama 3.2:1B ou Gemma 2:2B.

L'objectif était de créer un pipeline d'IA entièrement local capable d'extraire, de formater et de présenter les dossiers médicaux des patients tout en garantissant la confidentialité et le contrôle total des données.

Toutes les données des patients utilisées dans cette démonstration proviennent de paquets FHIR, qui ont été analysés et chargés dans IRIS via le module IRIStool. Cette approche facilite la requête, la conversion et la vectorisation des données de soins de santé à l'aide d'opérations pandas familières en Python. Si vous désirez en savoir plus sur la manière dont j'ai construit cette intégration, consultez mon article précédent Création d'un référentiel vectoriel FHIR avec InterSystems IRIS et Python via le module IRIStool.

Les deux outils, IRIStool et FHIR Data Explorer sont disponibles sur InterSystems Open Exchange — et font partie de mes contributions au concours. Si vous les trouvez utiles, n'hésitez pas à voter pour eux!

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Certainement, vous avez tous entendu que FHIR était la panacée et la solution à tous les problèmes d'interopérabilité et de compatibilité entre les systèmes. Ici, nous pouvons voir l'un de ses défenseurs classiques qui tient une ressource FHIR dans sa main et l'apprécie énormément :

Mais pour le reste de nous autres mortels, nous allons faire une petite introduction.

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Article
· Mai 21, 2025 2m de lecture
Retour sur le Meetup FHIR France #13

Bonjour la Communauté !

Je voulais vous partager mes impressions du Meetup FHIR France #13, organisé par Fyrstain et sponsorisé par InterSystems – et franchement, c’était une soirée inoubliable ! C’était une soirée riche en échanges, en apprentissages et en belles rencontres !

L’accueil a débuté à 19h et @Guillaume Rongier a aidé à enregistrer les participants

Après avoir laissé les participants arriver tranquillement, nous avons officiellement lancé la soirée. Fanch Rouault a souhaité la bienvenue au nom de Fyrstain

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Bonjour, chers développeurs !

Dans cet article, je vais vous montrer comment configurer le référentiel FHIR + le serveur d'autorisation OAuth2/serveur de ressources sur IRIS for Health en suivant l'article précédent.

Dans la partie 1, nous vous présentons les préparatifs préliminaires, la configuration du serveur d'autorisation OAuth2 et l'obtention du jeton d'accès.
La partie 2 vous explique comment construire un référentiel FHIR et configurer un client/serveur de ressources OAuth2.

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La méthode InstallFoundation est manquante (IRIS 2023.2+)

IRIS 2023.2 est récemment sorti. Cette version a supprimé cette méthode InstallFoundation de cette classe HS.HC.Util.Installer. Il s’agissait d’une méthode privée et elle n’était pas documentée. Mais il a été largement utilisé par la communauté pour installer le serveur FHIR.

Donc si vous rencontrez cette erreur :

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Introduction

J'ai récemment participé à une séance pratique formidablement organisée par @Patrick Jamieson au cours de laquelle une application Angular a été configurée avec un serveur IRIS FHIR en suivant les protocoles définis par SMART On FHIR. J'ai trouvé cela très intéressant et j'ai donc décidé de développer ma propre application Angular et de profiter ainsi de ce que j'ai appris en la publiant au sein de la communauté.

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Lorsque nous créons un référentiel FHIR dans IRIS, nous avons un point de terminaison pour accéder à l'information, créer de nouvelles ressources, etc. Mais il y a certaines ressources dans FHIR que nous n'aurons probablement pas dans notre référentiel, par exemple, la ressource Binary (cette ressource renvoie des documents, comme des PDF par exemple).

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Introduction

Dans ce premier article, un tutoriel simple vous a aidé à mettre en place votre déploiement FHIRaaS.

Maintenant, allons plus loin et présentons une bibliothèque JS pour accéder à la ressource FHIR.

À la fin, deux exemples d'utilisation de cette bibliothèque seront présentés, explorant le type de ressource FHIR Appointment pour les rendez-vous.

SMART sur la bibliothèque FHIR JavaScript

FHIR est une API REST, vous pouvez donc utiliser n'importe quel client HTTP pour l'utiliser. Mais c'est toujours une bonne idée d'avoir de l'aide.

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Article
· Sept 22, 2023 8m de lecture
Stratégie Python pour Iris FHIR

Description

Avec le Serveur InterSystems IRIS FHIR, vous pouvez construire une stratégie pour personnaliser le comportement du serveur (pour plus de détails, consultez documentation).

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Ce référentiel contient une stratégie Python qui peut être utilisée comme point de départ pour construire votre propre stratégie en Python.

Cette stratégie de démonstration présente les caractéristiques suivantes :

  • Mettre à jour la déclaration de capacité pour supprimer la ressource Account (compte).
  • Simuler un système de gestion de consentement pour accorder ou non l'accès à la ressource Observation.
    • Si l'utilisateur a des droits suffisants, la ressource Observation est renvoyée.
    • Sinon, la ressource Observation n'est pas renvoyée.
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Dans l'article précédent, nous avons présenté l'architecture de notre projet SMART On FHIR, il est donc temps de passer aux choses sérieuses et de commencer à configurer tous les éléments qui seront nécessaires.

Nous commençons avec Auth0.

Configuration de l'Auth0

Commençons par créer un compte Auth0 avec un email valide, une fois enregistré il nous faut créer notre première application, et nous le ferons à partir du menu de gauche:

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Les fournisseurs de solutions numériques dans le domaine de la santé sont soumis à une pression croissante pour intégrer des systèmes complexes de données de santé tout en garantissant l'évolutivité, la sécurité et la conformité à des normes telles que HL7 FHIR. Les ressources FHIR (Fast Healthcare Interoperability Resources) ont révolutionné l'échange de données de santé en proposant un cadre normalisé qui permet à divers systèmes informatiques de santé de communiquer sans difficulté. Mais il ne suffit pas de se conformer aux normes FHIR pour surmonter les complexités de l'intégration des données de santé. Les partenaires de solutions doivent tirer parti de composants architecturaux avancés tels que les courtiers, les façades et les référentiels FHIR pour créer des solutions évolutives et efficaces. InterSystems offre toutes les fonctionnalités essentielles dont vous avez besoin pour mettre en œuvre FHIR pour vos données de santé, que ce soit sur site, dans un cloud public ou sous forme de service cloud géré par InterSystems.

Medical Science Hospital Lab Meeting healthcare

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Nous concluons cette série d'articles SMART On FHIR avec Auth0 et le référentiel FHIR d'InterSystems IRIS en passant en revue notre application développée en Angular 16.

Rappelons à quoi ressemble l'architecture définie pour notre solution:

Notre application qui servira de front-end correspond à la deuxième colonne et comme vous pouvez le voir, elle sera en charge de deux choses:

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Ces dernières années, l'émergence de la norme FHIR (Fast Healthcare Interoperability Resources) a suscité un enthousiasme croissant parmi les experts en informatique médicale du monde entier. Cette tendance n'est pas juste une autre itération des normes et de la technologie. Elle a le potentiel de transformer et révolutionner l'ensemble du secteur. Il est donc nécessaire de la rendre accessible au plus grand nombre, pour qu’elle ne se cantonne pas au domaine technique, mais soit adoptée par les décideurs et leaders d'opinion. Si SantExpo 2022 a déjà dévoilé de grands progrès à cet égard, nous devons aller encore plus loin.

L'ère de la norme FHIR : pourquoi FHIR devrait vous intéresser ?

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Article
· Oct 20, 2023 8m de lecture
Les Notes du FHIR User Day à Rennes

Bonjour à toutes et à tous !

InterSystems a sponsorisé le FHIR User Day qui a eu lieu lors de la semaine européenne de la e-santé. Et je voudrais partager avec vous mes notes de cet événement. Mais avant ça, j'ai le plaisir à vous infirmer que la journée a été entièrement filmée. Les vidéos des différentes interventions seront transmises dans les semaines à venir. Restez à l'écoute!

Sans perte de temps, voici toute l'info.

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Cet article a pour objectif de fournir au lecteur les informations suivantes:

  • Configuration et utilisation du serveur FHIR
  • Création d'un serveur d'autorisation OAuth2
  • Liaison entre le serveur FHIR et le serveur d'autorisation OAuth2 pour la prise en charge de SMART sur FHIR
  • Utilisation des capacités d'interopérabilité dans "IRIS for Health" pour filtrer les ressources FHIR
  • Création d'une opération personnalisée sur le serveur FHIR

Schéma de l'article:

Schema

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Introduction

Dans mon article précédent, j'ai présenté le module IRIStool, qui intègre de manière transparente la bibliothèque pandas pour Python à la base de données IRIS. Je vais maintenant vous expliquer comment utiliser IRIStool pour exploiter InterSystems IRIS comme base pour une recherche sémantique intelligente dans les données de soins de santé au format FHIR.

Cet article décrit ce que j'ai fait pour créer une base de données pour mon autre projet, FHIR Data Explorer. Les deux projets sont candidats au concours InterSystems actuel, alors n'hésitez pas à voter pour eux si vous les trouvez utiles.

Ils sont disponibles sur Open Exchange:

Dans cet article, nous aborderons les sujets suivants:

  • Connexion à la base de données InterSystems IRIS via Python
  • Création d'un schéma de base de données compatible FHIR
  • Importation de données FHIR au moyen d'intégrations vectorielles pour la recherche sémantique

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Bonjour aux développeurs !

Il est possible que vous ayez à mettre en œuvre des scénarios qui ne nécessitent pas de référentiel FHIR, mais qui transmettent des demandes FHIR, gèrent les réponses et, éventuellement, exécutent des transformations ou extraient certaines valeurs entre les deux. Je vous propose ici quelques exemples qui peuvent être mis en œuvre en utilisant les systèmes InterSystems IRIS For Health et HealthShare Health Connect.

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