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Mise à jour : ajout du support pour le modèle de régression Bonjour à toutes et à tous !

Dans ce bref article, je vous montrerai comment écrire un adaptateur pour IRIS Interoperability afin d'utiliser des modèles ML gérés par IRIS IntegratedML.

L'adaptateur

L'adaptateur utilise simplement les fonctions SQL d'IntegratedML comme prédiction PREDICT et probabilité PROBABILITY, pour obtenir la classe prédite par le modèle et sa probabilité. Il s'agit d'un simple SQL :
![code1][code1] [code1]: https://raw.githubusercontent.com/jrpereirajr/interoperability-integratedml-adapter/master/img/how-it-works-1.png

Salut la communauté,

Regardez cette vidéo pour découvrir le stockage en colonnes et découvrez comment il peut être utilisé dans la plate-forme de données InterSystems IRIS pour améliorer la vitesse de vos requêtes analytiques et stocker efficacement les données :

⏯️ Qu'est-ce que le stockage en colonne ?

InterSystems a corrigé un défaut pouvant entraîner une instabilité du client ECP (Enterprise Cache Protocol) dans de rares cas.

Le défaut existe dans les produits suivants et dans toutes les offres InterSystems basées sur ceux-ci.

Les versions concernées sont 2022.1.x, 2022.2 et 2022.3 :

InterSystems IRIS®

InterSystems IRIS for Health™

HealthShare® Connexion Santé

La version concernée est 2022.2 (uniquement pour les clients déployant ECP) :

InterSystems HealthShare®

Le problème ne peut se produire que sur les systèmes clients ECP.

InterSystems a corrigé un défaut qui pouvait amener une requête SQL à renvoyer des résultats incorrects.

Le défaut existe dans les produits suivants et dans toutes les offres InterSystems basées sur ceux-ci.

Les versions concernées sont 2021.2, 2022.1.x, 2022.2 et 2022.3 :

InterSystems IRIS®

InterSystems IRIS for Health™

HealthShare® Connexion Santé

La version impactée est 2022.2 :

InterSystems HealthShare®

Le problème peut être déclenché lorsque SQL Runtime Plan Choice (RTPC) est activé (valeur par défaut) et que la requête contient une "valeur de vérité" WHERE ? = ?

Mots-clés:  IRIS, IntegratedML, apprentissage automatique, Covid-19, Kaggle 

Continuation de la précédente Partie I ... Dans la partie I, nous avons parcouru les approches ML traditionnelles sur ce jeu de données Covid-19 sur Kaggle.

Dans cette partie II, nous allons exécuter les mêmes données et la même tâche, dans sa forme la plus simple possible, à travers IRIS integratedML qui est une interface SQL agréable et élégante pour les options AutoML du backend. Cette interface utilise le même environnement. 

Keywords:  IRIS, IntegratedML, apprentissage automatique, Covid-19, Kaggle 

Objectif

J'ai récemment remarqué un jeu de données Kaggle permettant de prédire si un patient Covid-19 sera admis en soins intensifs. Il s'agit d'un tableur de 1925 enregistrements comprenant 231 colonnes de signes vitaux et d'observations, la dernière colonne " USI " valant 1 pour Oui ou 0 pour Non.

Ce jeu de données représente un bon exemple de ce que l'on appelle une tâche "traditionnelle de ML". Les données semblent avoir une quantité suffisante et une qualité relativement bonne.

Je suis heureux d'annoncer la version 2.6.0 de l'extension VS Code ObjectScript, contenant un certain nombre d'améliorations qui facilitent la vie d'un développeur. Certains faits saillants sont décrits ci-dessous. Comme toujours, retrouvez la liste complète des modifications dans le CHANGELOG, y compris de nombreux correctifs de bogues et de vulnérabilités.

Changez rapidement de namespace

Merci à @Olli Tanskanen de la société partenaire JediSoft Oy pour cette amélioration !

Ce Template s'agit du modèle de base pour utiliser InterSystems IRIS for Health Community Edition en tant que serveur FHIR.

Il configure un SERVEUR FHIR, importe les données de test, fait la démonstration de l'utilisation de l'API REST avec une simple page web.

Conditions préalables

Assurez-vous que vous avez installé git et Docker desktop.

Installation

IPM

Ouvrez l'installation d'IRIS for Health avec le client IPM installé. Appel dans n'importe quel espace de nom :

USER>zpm "install fhir-server"

Ainsi, le serveur FHIR sera installé dans l'espace de noms FHIRSERVER.

Je voulais donner un aperçu d'une amélioration de la façon dont nous générons et appelons le code de méthode dans IRIS 2023.1.

Une classe dans IRIS est composée de deux composants d'exécution principaux :

1. Descripteur de classe - une liste hautement optimisée de méthodes, propriétés, paramètres de classe qui composent la classe ainsi que les attributs associés à chacun d'entre eux, par ex. cadre public/privé.
2. Code ObjectScript : ensemble de routines contenant le code ObjectScript à exécuter lorsqu'une méthode est appelée.

Introduction

Dans un article précédent, j'ai abordé les modèles d'exécution des tests unitaires via le gestionnaire de paquets ObjectScript. Cet article va un peu plus loin, en utilisant les actions GitHub pour piloter l'exécution des tests et la création de rapports. Le cas d'utilisation qui nous motive est l'exécution du CI pour l'un de mes projets Open Exchange, AppS.REST (voir l'article d'introduction à ce projet ici). Vous pouvez voir l'implémentation complète dont les extraits de cet article ont été tirés sur GitHub ; elle pourrait facilement servir de modèle pour l'exécution de l'IC pour d'autres projets utilisant le gestionnaire de paquets ObjectScript.

Les fonctionnalités dont la mise en œuvre a été démontrée comprennent :

• Compilation et test d'un paquet ObjectScript
• Rapport sur la mesure de la couverture des tests (en utilisant le paquet TestCoverage) via codecov.io
• Téléchargement d'un rapport sur les résultats des tests en tant qu'artefact de comppilation.

Selon une étude menée par IDC, 83% des CEO souhaitent que leur organisation soit plus axée sur l’utilisation de la donnée. Paradoxalement, 92% d’entre eux n’ont pas confiance dans les données de leur entreprise. Comment convaincre les décideurs d’appuyer davantage leurs décisions sur les données (Data Driven) plutôt que sur leurs intuitions et leurs connaissances du métier ?

Les enjeux actuels dans la chaîne d’approvisionnement confirment que les données s’imposent comme un actif précieux et indispensable dans l’élaboration et l’exécution d’une stratégie Data Driven.

Lors d'une montée de version majeure il est conseillé de recompiler les classes et les routines de tous vos espaces de noms (cf. Major Version Post-Installation Tasks).

do $system.OBJ.CompileAllNamespaces("u")

do ##Class(%Routine).CompileAllNamespaces()

Pour automatiser cette tâche d'administration et conserver un journal des erreurs éventuelles, vous trouverez ci-dessous un exemple d'une classe à importer et compiler dans l'espace de noms USER que vous pourrez utiliser après chaque montée de version : admin.utils.cls

Class admin.utils
{
ClassMethod upgrade(verbose As %Boolean = 0) As %Status
{
set ns=$Namespace
// Stopping all productions
do ..stopAllProductions(verbose)
zn "%sys"
kill ^[ns]upgradeLog
// UpgradeAll
set ^[ns]upgradeLog("UpgradeAll")=$zdt($now(),3,,6)
set start=$zh
do $system.OBJ.UpgradeAll(,.errorLogUpgrade)
do ##class(%SYSTEM.OBJ).UpgradeAll()
set ^[ns]upgradeLog("UpgradeAll","duration")=$zh-start
merge ^[ns]upgradeLog("UpgradeAll","errors")=errorLogUpgrade
// Compile Classes in All Namespaces
set ^[ns]upgradeLog("classes")=$zdt($now(),3,,6)
set start=$zh
do $system.OBJ.CompileAllNamespaces("cbk",.errorLogClasses
set ^[ns]upgradeLog("classes","duration")=$zh-start
merge ^[ns]upgradeLog("classes","errors")=errorLogClasses
// Compile Routines in All Namespaces
set ^[ns]upgradeLog("routines")=$zdt($now(),3,,6)
set start=$zh
do ##Class(%Library.Routine).CompileAllNamespaces(,,.count,.errorLogRoutines)
set ^[ns]upgradeLog("routines","duration")=$zh-start
merge ^[ns]upgradeLog("routines","errors")=errorLogRoutines
merge ^[ns]upgradeLog("routines","count")=coun
// Starting all productions
do ..startAllProductions(verbose)
zn ns
return $$$OK
}

ClassMethod startAllProductions(verbose As %Boolean = 0) As %Status
{
set sc=$$$OK
set ns=$Namespace
set sc=##class(%SYS.Namespace).ListAll(.namespacesList)
set namespace=$ORDER(namespacesList(""))
while (namespace'="") {
 if (##class(%EnsembleMgr).IsEnsembleNamespace(namespace))&&(namespace'["^^") {
 write:verbose namespace
 zn namespace
 kill prodname,status
 set sc=##class(Ens.Director).GetProductionStatus(.prodname,.status)
 if status=2 {
 write:verbose " starting production "_prodname,!
 set sc=##class(Ens.Director).StartProduction()
}

write:verbose !
zn ns
}
set namespace=$ORDER(namespacesList(namespace))
}
return sc
}

ClassMethod stopAllProductions(verbose As %Boolean = 0) As %Status
{
set sc=$$$OK
set ns=$Namespace
set sc=##class(%SYS.Namespace).ListAll(.namespacesList)
set namespace=$ORDER(namespacesList(""))
while (namespace'="") {

if (##class(%EnsembleMgr).IsEnsembleNamespace(namespace))&&(namespace'["^^") {

write:verbose namespace
zn namespace
kill prodname,status
set sc=##class(Ens.Director).GetProductionStatus(.prodname,.status)
if status=1 {
write:verbose " stopping production "_prodname,!
set sc=##class(Ens.Director).StopProduction(0,1)
}
write:verbose !
zn ns
}
set namespace=$ORDER(namespacesList(namespace))
}
return sc
}

 

ClassMethod restartAllProductions(verbose As %Boolean = 0) As %Statu
{
set sc=$$$OK
set ns=$Namespace
set sc=##class(%SYS.Namespace).ListAll(.namespacesList)
set namespace=$ORDER(namespacesList(""))
while (namespace'="") {
if (##class(%EnsembleMgr).IsEnsembleNamespace(namespace))&&(namespace'["^^") {
write:verbose namespace
zn namespace
kill prodname,status
set sc=##class(Ens.Director).GetProductionStatus(.prodname,.status)
if status=1 {
write:verbose " restarting production "_prodname,!
set sc=##class(Ens.Director).RestartProduction(0,1)
}
write:verbose !
zn ns
}
set namespace=$ORDER(namespacesList(namespace))
}
return sc
}

ClassMethod cleanAllProductions(verbose As %Boolean = 0) As %Status
{
set sc=$$$OK
set ns=$Namespace
set sc=##class(%SYS.Namespace).ListAll(.namespacesList)
set namespace=$ORDER(namespacesList(""))
while (namespace'="") {
if (##class(%EnsembleMgr).IsEnsembleNamespace(namespace))&&(namespace'["^^") {
write:verbose namespace
zn namespace
kill prodname,status
set sc=##class(Ens.Director).GetProductionStatus(.prodname,.status)
if status=3 {
write:verbose " cleaning production "_prodname,!
set sc=##class(Ens.Director).CleanProduction(1)
}
write:verbose !
zn ns
}
set namespace=$ORDER(namespacesList(namespace))
}
return sc
}
}

Kong fournit en open source un outil de gestion de ses configurations (écrit en Go), appelé decK (pour declarative Kong)

• Vérifiez que decK reconnaît votre installation Kong Gateway via deck ping

deck ping   
Successfully connected to Kong!
Kong version:  2.3.3.2-enterprise-edition

• Exporter la configuration de Kong Gateway dans un fichier "kong.yaml" via deck dump

deck dump

• Après avoir modifié le kong.yaml, afficher les différences via deck diff

deck diff
updating service alerts  {
   "connect_timeout": 60000,
-  "host": "172.24.156.176",
+  "host": "192.10.10.18",
   "id": "3bdd7db4-0b75-4148-93b3-2ff11e961f64",
   "name": "alerts",
   "path": "/alerts",
   "port": 50200,
   "protocol": "http",
   "read_timeout": 60000,
   "retries": 5,
   "write_timeout": 60000
 }

Summary:
  Created: 0
  Updated: 1
  Deleted: 0

Dans cet article, je vais vous montrer comment vous pouvez facilement conteneuriser les passerelles .Net/Java.

Pour notre exemple, nous allons développer une intégration avec Apache Kafka.

Et pour interopérer avec le code Java/.Net, nous utiliserons PEX.

Architecture

Notre solution fonctionnera entièrement dans docker et ressemblera à ceci :

Passerelle Java

Tout d'abord, nous allons développer l'opération Java pour envoyer des messages dans Kafka. Le code peut être écrit dans l'IDE de votre choix et il peut ressembler à ceci.