Traitement des ressources FHIR avec FHIR SQL BUILDER pour prédire la probabilité de développer une hépatite C

Avec le développement de la technologie, l'industrie médicale progresse également constamment et les humains accordent souvent plus d'attention à leur propre santé.
En apprenant et en traitant des ensembles de données par ordinateur, les maladies peuvent être prédites.

Prérequis: Capacité à utiliser FHIR et ML

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La communauté des développeurs d'InterSystems compte 22,340 développeurs incroyables
Ici, les programmeurs d'InterSystems IRIS apprennent et partagent, se tiennent informés, évoluent ensemble et s'amusent !
Article
· Sept 14, 2023 8m de lecture
Procédure stockée en Embedded Python

Aperçu

La documentation en ligne contient une référence expliquant comment définir et utiliser les requêtes de classes.

La personnalisation des procédures stockées en ObjectScript s'est avérée utile pour accéder au stockage NoSQL et à la messagerie externe via l'intégration, afin de présenter la sortie sous forme de tableau.

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Bonjour, chers développeurs !

Dans cet article, je vais vous montrer comment configurer le référentiel FHIR + le serveur d'autorisation OAuth2/serveur de ressources sur IRIS for Health en suivant l'article précédent.

Dans la partie 1, nous vous présentons les préparatifs préliminaires, la configuration du serveur d'autorisation OAuth2 et l'obtention du jeton d'accès.
La partie 2 vous explique comment construire un référentiel FHIR et configurer un client/serveur de ressources OAuth2.

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Cette publication est le résultat direct d'une collaboration avec un client d'InterSystems qui est venu me consulter pour le problème suivant :

SELECT COUNT(*) FROM MyCustomTable

Cela prend 0,005 secondes, pour un total de 2300 lignes. Cependant :

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Certainement, vous avez tous entendu que FHIR était la panacée et la solution à tous les problèmes d'interopérabilité et de compatibilité entre les systèmes. Ici, nous pouvons voir l'un de ses défenseurs classiques qui tient une ressource FHIR dans sa main et l'apprécie énormément :

Mais pour le reste de nous autres mortels, nous allons faire une petite introduction.

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Rubrique FAQ InterSystems

Vous pouvez définir des pages d'erreur individuelles en fonction des différents types de messages d'erreur ou de réponses système de la passerelle Web :

  • erreur de serveur
  • serveur occupé
  • serveur indisponible
  • délai d'attente du serveur
  • connexion fermée

Les paramètres sont définis sur l'écran Gestion de passerelle Web ([Portail d'Administration] > [Administration système] > [Configuration] > [Gestion de passerelle Web] > [Configuration] > [Default Parameters]).

Dans la section "Error Pages" du menu "Default Parameters", indiquez le nom de fichier de la page html à afficher ou l'URL vers laquelle rediriger la réponse lorsqu'une erreur se produit.

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Article
· Jan 16, 2023 2m de lecture
EDS - Stockage des données de santé

Comment stocker efficacement les données de santé ?

Normalisation des données de santé

De nombreuses organisations « déchantent » des Data Lakes dans lesquels les données sont stockées massivement sans avoir été préalablement normalisées. Trop de données « non propres » rendent ces Data Lakes inexploitables. Les organisations reviennent alors aux fondamentaux que sont la capture, la normalisation, le stockage et l’exploitation pour la mise en œuvre de Data Fabrics.

Il existe 3 modèles de stockage des données :

  • Adhoc - modèles propriétaires
  • FHIR « friendly » – stockage selon la norme FHIR
  • OMOP et I2B2 – modèles universitaires orientés recherches cliniques

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Summary

Il existe encore des systèmes dans le secteur de la santé qui utilisent PB9, Delphi7 et d'autres langages. Pour accélérer le processus de développement et permettre aux applications tierces d'invoquer built-in le service web HL7 V2 intégré fourni par Ensemble ou IRIS, nous présentons ici plusieurs exemples d'invocations de l'interface SOAP HL7 V2 d'Ensemble en utilisant Java, PB9 et Delphi7.

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Dans cet article, nous allons voir comment utiliser le service de messagerie instantanée WhatsApp depuis InterSystems IRIS pour envoyer des messages à différents destinataires. Pour ce faire, nous devons créer et configurer un compte dans Meta et configurer une opération métier pour envoyer les messages que nous souhaitons.

Examinons chacune de ces étapes plus en détail.

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Le sous-système Windows pour Linux (WSL) est une fonctionnalité de Windows qui vous permet d'exécuter un environnement Linux sur votre ordinateur Windows, sans avoir besoin d'une machine virtuelle distincte ni d'un double démarrage.

WSL est conçu pour offrir une expérience transparente et productive aux développeurs qui souhaitent utiliser à la fois Windows et Linux**.

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Salut les développeurs,

Dans cet article, je vais vous montrer comment exécuter du code au moment de la compilation avec les macros ObjectScript.

Voici un cas d'utilisation qui m'a récemment amené à utiliser cette fonctionnalité :

Dans le cadre d'une application médicale développée depuis plus de 20 ans, nous avons un grand nombre de paramètres. Bien que nous disposions de procédures pour documenter ces paramètres, il peut être utile d'avoir une vue rapide sur les paramètres réellement utilisés par le code de l'application.

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Salut,

J'ai un message ORU, qui a un segment EVN que je veux supprimer et envoyer le message à travers. J'ai essayé de cloner la demande comme ci-dessous :

s newreq = request.constructClone
s changereq = newreq.RemoveSegmentAt("EVN")
s request  = changereq

mais cela échoue.

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Rubrique FAQ InterSystems

La page de gestion de Web/CSP Gateway est généralement configurée de manière à ne pas être accessible à partir des machines clientes.

Pour y accéder depuis n'importe quel client, procédez comme suit :

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[Introduction]

La famille InterSystems IRIS a un utilitaire intéressant : ^SystemPerformance (aussi connu comme ^pButtons pour Caché et Ensemble) qui génère les informations sur les performances de la base de données dans un fichier HTML lisible. Lorsque vous exécutez ^SystemPerformance sur IRIS pour Windows, un fichier HTML est créé dans lequel notre propre journal de performances mgstat et notre journal de performances Windows sont inclus.

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Titre: Le plan de travail pour la future version 3.13 de Python a été dévoilé

Résumé: Le plan de travail pour la future version 3.13 de Python a été dévoilé, mettant l'accent sur deux objectifs majeurs : la réduction d'au moins 50% du temps passé dans l'interpréteur et une meilleure gestion de la mémoire. L'article présente les principales pistes envisagées pour atteindre ces objectifs ambitieux. Des améliorations spécifiques dans le fonctionnement de l'interpréteur Python sont explorées, visant à accélérer l'exécution des scripts et à rendre Python encore plus performant. La gestion de la mémoire est également au centre des préoccupations, avec des projets pour réduire la consommation et optimiser l'utilisation des ressources système. Cette future version de Python promet des avancées significatives qui pourraient impacter positivement les performances et l'efficacité des applications développées en Python. Les développeurs et passionnés de Python ont de quoi être enthousiastes quant aux améliorations à venir dans cette version 3.13 !

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Introduction

Dans un article précédent, j'ai abordé les modèles d'exécution des tests unitaires via le gestionnaire de paquets ObjectScript. Cet article va un peu plus loin, en utilisant les actions GitHub pour piloter l'exécution des tests et la création de rapports. Le cas d'utilisation qui nous motive est l'exécution du CI pour l'un de mes projets Open Exchange, AppS.REST (voir l'article d'introduction à ce projet ici). Vous pouvez voir l'implémentation complète dont les extraits de cet article ont été tirés sur GitHub ; elle pourrait facilement servir de modèle pour l'exécution de l'IC pour d'autres projets utilisant le gestionnaire de paquets ObjectScript.

Les fonctionnalités dont la mise en œuvre a été démontrée comprennent :

  • Compilation et test d'un paquet ObjectScript
  • Rapport sur la mesure de la couverture des tests (en utilisant le paquet TestCoverage) via codecov.io
  • Téléchargement d'un rapport sur les résultats des tests en tant qu'artefact de comppilation.
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EnsLib.HL7.Message.cls fournit de nombreuses méthodes API pour manipuler un message HL7. RemoveSegmentAt(), par exemple, peut être utilisé pour supprimer un segment par chemin ou par index, mais pas plus d'un segment à la fois. Il peut arriver que vous ayez besoin de supprimer tous les segments d'un groupe ou même de nombreux groupes de segments du message HL7. Bien sûr, vous pouvez itérer à travers chaque segment dans chaque groupe et les supprimer un par un, mais il y a un moyen beaucoup plus facile.

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J'essaie d'installer les packages requis pour utiliser .Net avec HealthShare comme ci-dessous.


Mais je ne peux pas utiliser Nuget pour le faire, et la documentation semble assez vague, doit-elle être configurée sur la même machine que l'instance InterSystems ?

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La recherche d'images comme celle de Google est une fonctionnalité intéressante qui m'émerveille - comme presque tout ce qui est lié au traitement des images.

Il y a quelques mois, InterSystems a publié un aperçu de Python Embedded. Comme Python dispose de nombreuses librairies pour le traitement d'images, j'ai décidé de lancer ma propre tentative pour jouer avec une sorte de recherche d'images - une version beaucoup plus modeste en fait :-)



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Bonjour,

Je suis toujours en train de préparer le terrain pour inclure la librairie de Guillaume Rongier pour utiliser InterSystems entièrement via Python. Cependant notre environnement local tourne sur Docker avec l'OS linux, jusque là nous n'avons aucun problème avec la librairie. Le problème arrive lorsque l'on passe sur la pré-production où iris est installé directement sur Windows. J'installe les librairies requises avec le package pip et un fichier requirements.txt contenant ceci:

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Bonjour,

Depuis ce matin j'arrive pas à compiler ou lancer mes programmes qui tourne en local sur docker avec l'image : intersystemsdc/irishealth-community:2024.1-zpm

J'ai toujours cette erreur sur le terminal ou le portal de management : request to http://localhost:52773/api/atelier/ failed, reason: socket hang up

Dans mes logs docker aussi j'ai des erreurs en conitnu , voici un extrait ...

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