Introduction

Dans ce premier article, un tutoriel simple vous a aidé à mettre en place votre déploiement FHIRaaS.

Maintenant, allons plus loin et présentons une bibliothèque JS pour accéder à la ressource FHIR.

À la fin, deux exemples d'utilisation de cette bibliothèque seront présentés, explorant le type de ressource FHIR Appointment pour les rendez-vous.

SMART sur la bibliothèque FHIR JavaScript

FHIR est une API REST, vous pouvez donc utiliser n'importe quel client HTTP pour l'utiliser. Mais c'est toujours une bonne idée d'avoir de l'aide.

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Les systèmes de bases de données ont des exigences de sauvegarde très spécifiques qui, dans les déploiements d'entreprise, nécessitent une réflexion et une planification préalables. Pour les systèmes de bases de données, l'objectif opérationnel d'une solution de sauvegarde est de créer une copie des données dans un état équivalent à celui de l'arrêt de l'application en douceur. Les sauvegardes cohérentes avec les applications répondent à ces exigences et Caché fournit un ensemble d'API qui facilitent l'intégration avec des solutions externes pour atteindre ce niveau de cohérence des sauvegardes.

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En discutant avec un de mes amis, spécialiste du Machine Learning @Renato Banzai , il a évoqué l'un des plus grands défis pour les entreprises aujourd'hui : le déploiement du ML/IA dans des environnements réels.

InterSystems IRIS propose la solution "IntegratedML". IntegratedML est une fonctionnalité très utile pour entraîner, tester et déployer des modèles de ML/IA.

La partie la plus difficile dans la création de ML/IA est de faire le traitement des données, de les nettoyer et de les rendre fiables.

C'est là que nous pouvons tirer parti de la puissante norme FHIR !

L'idée du projet montre comment nous pouvons créer/entraîner/valider des modèles MI/IA avec FHIR et les utiliser avec des données provenant de différentes sources.

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Vous avez probablement entendu parler des bases de données NoSQL. Il existe plusieurs définitions, mais pour simplifier, ce terme est couramment utilisé pour désigner les bases de données qui n'utilisent littéralement pas le langage SQL, c'est-à-dire les bases de données autres que les bases de données relationnelles (RDB).

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** Révisé le 12 février 2018

Bien que cet article concerne InterSystems IRIS, il s’applique également aux distributions Caché, Ensemble et HealthShare.

Introduction

La mémoire est gérée en pages. La taille de page par défaut est de 4 Ko sur les systèmes Linux. Red Hat Enterprise Linux 6, SUSE Linux Enterprise Server 11 et Oracle Linux 6 ont introduit une méthode permettant d’augmenter la taille des pages en 2 Mo ou 1 Go en fonction de la configuration du système, connue sous le nom de HugePages.

Au début, les HugePages devaient être attribuées au démarrage et, si elles ne sont pas gérées ou calculées correctement, elles pourraient entraîner un gaspillage de ressources. En conséquence, diverses distributions Linux ont introduit Transparent HugePages avec le noyau 2.6.38 activé par défaut. Il s’agissait d’un moyen d’automatiser la création, la gestion et l’utilisation de HugePages. Les versions antérieures du noyau peuvent également avoir cette fonctionnalité, mais peuvent ne pas être marquées comme [toujours] et potentiellement définies sur [madvise].

Transparent Huge Pages (THP) est un système de gestion de la mémoire Linux qui réduit la surcharge des recherches TLB (Translation Lookaside Buffer) sur les machines avec de grandes quantités de mémoire en utilisant des pages de mémoire plus grandes. Cependant, dans les versions Linux actuelles, THP ne peut mapper que l’espace de tas et de pile de processus individuels.

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Salut la communauté,


Dans mon article précédent, nous avons appris les sujets répertoriés ci-dessous :

  1. Qu’est-ce que Docker ?
  2. Certains des avantages de Docker
  3. Comment fonctionne Docker ?
  4. Image Docker
  5. Conteneur Docker
  6. Dépôt d'images Docker
  7. Dépôt d'images Docker d'InterSystems
  8. Installation de Docker
  9. Commandes de base de Docker
  10. Exécution de l'édition communautaire IRIS à l'aide de Docker
  11. Interface graphique du bureau Docker

Dans cet article, nous aborderons les sujets suivants

  1. Utilisation du fichier Docker Compose (un fichier YAML)
  2. Utilisation du fichier Docker (utilisé pour créer une image Docker)
  3. Utilisation du volume Docker

Alors commençons.

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Article
· Mai 17, 2023 16m de lecture
Configuration du Miroir dans Docker

Nos clients ont souvent besoin de configurer HealthShare HealthConnect et IRIS en mode haute disponibilité.

D'autres moteurs d'intégration sur le marché sont souvent présentés comme ayant des configurations de "haute disponibilité", mais ce n'est pas vraiment le cas. En général, ces solutions fonctionnent avec des bases de données externes et donc, si celles-ci ne sont pas configurées en haute disponibilité, lorsqu'un crash de la base de données se produit ou que la connexion à celle-ci est perdue, l'ensemble de l'outil d'intégration devient inutilisable.

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Bonjour, chers développeurs !

Dans cette série, je ne vous montrerai pas comment utiliser IRIS for Health, mais plutôt comment utiliser SUSHI, un outil de création de profils FHIR, en tant que technologie associée.

Quand on a les outils adéquats, les informations du profil (spécifications, limitations, extensions, etc.) d'un projet FHIR peuvent être bien organisées et publiées.

Avant de commencer, qu'est-ce que le SUSHI ? Je vais l'expliquer brièvement.

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pour démonter/monter une base de données, utilisez les méthodes Dismount() et Mount() dans la classe SYS.Database disponible dans l'espace de noms %SYS.
NB : l'ID de la base de données est le nom du chemin absolu de son répertoire.

Vous trouverez quelques exemples de démontage/montage et de méthodes contrôlant si une base de données est montée (Mounted=1) ou non (Mounted=0), ou affichant rapidement tous les attributs d'une base de données (via zwrite)

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Une production simple qui permet de charger des paquets de transactions FHIR dans le serveur FHIR® d'InterSystems® via Box et Dropbox.&nbsp ; En utilisant les composants de connexion MFT inclus et un processus personnalisé Custom Business Process de 14 lignes, cette production traitera vos paquets de transactions vers les ressources FHIR pour une consommation immédiate à la manière magique digne d'Harry Potter. Idéal pour les Hackathons, la recherche et les cocktails FHIR®.

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La méthode InstallFoundation est manquante (IRIS 2023.2+)

IRIS 2023.2 est récemment sorti. Cette version a supprimé cette méthode InstallFoundation de cette classe HS.HC.Util.Installer. Il s’agissait d’une méthode privée et elle n’était pas documentée. Mais il a été largement utilisé par la communauté pour installer le serveur FHIR.

Donc si vous rencontrez cette erreur :

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InterSystems FAQ rubric

Si le système ne s'arrête pas pendant 24 heures, les anciens fichiers journaux seront supprimés à 0h30 selon les « Paramètres de suppression des fichiers journaux ».

Une cause possible pour laquelle des fichiers journaux restants sont plus anciens que les « Paramètres de suppression des fichiers journaux » est que certaines transactions restent ouvertes.

Dans ce cas, vous pourrez supprimer le fichier journal en recherchant les processus exécutant les transactions et en finalisant les transactions.

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La nouveauté de la version 2023.3 (d'InterSystems IRIS for Health) est une fonctionnalité permettant d'effectuer une validation basée sur le profil FHIR.

(*)

Dans cet article, je vais fournir un aperçu de base de cette fonctionnalité.

Si FHIR est important pour vous, vous devriez absolument essayer cette nouvelle fonctionnalité, alors poursuivez votre lecture.

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Summary

Il existe encore des systèmes dans le secteur de la santé qui utilisent PB9, Delphi7 et d'autres langages. Pour accélérer le processus de développement et permettre aux applications tierces d'invoquer built-in le service web HL7 V2 intégré fourni par Ensemble ou IRIS, nous présentons ici plusieurs exemples d'invocations de l'interface SOAP HL7 V2 d'Ensemble en utilisant Java, PB9 et Delphi7.

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Les systèmes EHR (Electronic Health Record) sont modélisés dans un format/structure propriétaire et ne sont pas basés sur des modèles du marché tels que FHIR ou HL7. Certains de ces systèmes peuvent interopérer des données dans un format propriétaire pour FHIR et d'autres modèles de marché, mais pas tous. InterSystems dispose de deux plateformes capables d'interopérer des formats propriétaires pour ceux du marché : InterSystems HealthShare Connect et InterSystems IRIS for Health. La fonctionnalité de transformation (DTL - Data Transformation Language) de ces plateformes peut recevoir des données dans n'importe quel format, structure ou canal de communication (CSV, JSON, XML, et autres via FTP, File, HTTP, etc.) et les transformer directement en formats du marché (FHIR, CDA, HL7, etc.). Cependant, InterSystems dispose d'un format intermédiaire appelé SDA (Summary Document Architecture) qui est utilisé par ces plateformes pour générer sans effort des FHIR STU, R3, R4, HL7v2, HL7v3, etc. En outre, lorsqu'elles sont au format SDA, les données de santé peuvent être conservées dans le RCU HealthShare. Ainsi, le format propriétaire/personnel est d'abord transformé en SDA, puis les données peuvent être automatiquement converties dans n'importe quel format du marché, ainsi que sauvegardées dans HealthShare. Dans cet article, nous allons vous montrer comment transformer des données propriétaires/personnalisées en SDA à l'aide d'IRIS for Health. L'exemple de données que nous avons utilisé a été généré par le projet de génération de données en masse SYNTHEA (https://synthea.mitre.org/downloads). Nous allons convertir 1000 patients d'un fichier CSV en SDA, en utilisant les fonctions d'interopérabilité d'IRIS for Health.

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Article
· Sept 18, 2023 22m de lecture
Déploiement local d'un serveur FHIR sur K8s

k8s

Voici un exemple de déploiement de iris-oauth-fhir sur k3d avec IKO.
* iris-oauth-fhir est un exemple de déploiement d'un serveur FHIR avec authentification OAuth2 en utilisant InterSystems IRIS for Health comme serveur de ressources et Google OpenId comme serveur d'autorisation.
* k3d est un wrapper léger pour exécuter k3s (la distribution Kubernetes minimale de Rancher Lab) dans docker.
* IKO est un outil permettant de déployer InterSystems IRIS for Health sur Kubernetes.

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Le projet fhir-react est un cadre d'interface utilisateur React basé sur Google Material Design, qui couvre presque toutes les ressources FHIR pour les versions DSTU2, STU3 et R4.

Sa conception est très simple : il n'y a qu'un seul composant ! Comme les types de ressources FHIR sont des standards, le framework résout de manière interne quelle classe de rendu doit être utilisée.

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Voulez-vous être sûr que vos transformations de données fonctionnent comme prévu avec une seule commande ? Et que diriez-vous d'écrire des tests unitaires pour vos transformations de données de manière simple et rapide ?

Les transformations de données sont généralement très présentes lorsqu'on parle d'interopérabilité. Ces transformations de données sont utilisées pour convertir les données entre différents systèmes ou applications dans votre code, et elles ont donc un rôle très important à jouer.

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Article
· Sept 22, 2023 8m de lecture
Stratégie Python pour Iris FHIR

Description

Avec le Serveur InterSystems IRIS FHIR, vous pouvez construire une stratégie pour personnaliser le comportement du serveur (pour plus de détails, consultez documentation).

Image

Ce référentiel contient une stratégie Python qui peut être utilisée comme point de départ pour construire votre propre stratégie en Python.

Cette stratégie de démonstration présente les caractéristiques suivantes :

  • Mettre à jour la déclaration de capacité pour supprimer la ressource Account (compte).
  • Simuler un système de gestion de consentement pour accorder ou non l'accès à la ressource Observation.
    • Si l'utilisateur a des droits suffisants, la ressource Observation est renvoyée.
    • Sinon, la ressource Observation n'est pas renvoyée.
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